Нижчі гриби
Вегетативна їх фаза складається з рухомої багатоядерної протоплазматической маси, що не має клітинних стінок (плазмодія), або агрегату амебоидных голих клітин, які зберігають індивідуальність (псевдоплазмодия). Харчування може бути і абсорбтивным, і голозойным.
Якщо є жгутиконосные клітини, то в них присутня зазвичай два різних джгутика. Спорангії і суперечки, як правило, численні. У складі подцарства присутній один тип (відділ) – миксомицеты.
Вищі гриби
У цих організмів відсутня псевдоплазмодий і плазмодій. Вегетативна фаза представлена нитками (гіфами) або клітинами з яскраво вираженою стінкою. Харчування виключно абсорбтивное. Якщо присутні джгутикові клітини, то в них один або два джгутика.
У складі подцарства виділяють відділи:
- Зооспоровые (або мастигомицеты).
- Зигомицеты.
- Аскоміцети.
- Базидомицеты.
- Недосконалі гриби (штучний відділ).