Подцарство бактерій
Ці організми мають гетеротрофную або автотрофную (хемотрофную, рідше фторотрофную) систему харчування. Якщо є хлорофіл, то він представлений бактериохлорофиллами. У бактерій відсутня фикоэритрин і фікоцианін. В процесі фотосинтезу молекулярний кисень не виділяється. Часто виявляються прості джгутики.
У подцарство, крім справжніх бактерій, віднесені спірохети, миксобактерии, актиноміцети, рикетсії, мікоплазми, хламідії і, можливо, віруси. Треба зазначити, що ця ланка ще недостатньо вивчено, і цілком імовірно, в майбутньому може бути переглянуте його значення в системі органічного світу та еволюції.
Цианеи
Організми цього подцарства відрізняються автотрофным (фотосинтетическим) живленням. Хлорофіл представлений у вигляді хлорофілу а. Допоміжними фотосинтезирующими елементами виступають фикоэритрин і фікоцианін. Процес фотосинтезу супроводжується виділенням молекулярного кисню.
У подцарство включені синьозелені водорості, які формують один відділ.
