Закінчення кар’єри
У 1849 році Федір Петрович іде зі своїх постів в якості віце-адмірала. Це звання є третім за старшинством у всій системі рангів військово-морського флоту, поступаючись тільки самому адміралу і адміралу флоту. На даний момент воно порівнянно з генералом-лейтенантом в сухопутних військах.
Правда, навіть перебуваючи у відставці Фердинанд Петрович Врангель досить-таки тісно співпрацює з Петербурзькою Академією наук, у 1855 році стає її членом з особливими почестями. Взагалі, Петербурзька Академія наук – це узагальнена назва вищого наукового закладу, прийняте в літературі для Російської імперії 1724-1917 років.
У цьому ж році він стає засновником Російського географічного товариства, одного з найстаріших у світі, поступаючись тільки Паризькому, заснованому в 1821 році.
Кримська війна
З настанням Кримської війни Фердинанду доводиться повернутися з заслуженого відпочинку, і восьмого вересня 1854 року він призначається директором Гідрографічного управління, існуючого ще з часів правління Петра I і до сьогоднішніх днів. Потім барона Врангеля замінює Михайло Францевич Рейнеке, який, у свою чергу, залишає цей пост лише в 1859 році.
Двадцять третього лютого 1855 року він був призначений головою Морського вченого комітету, через деякий час, тринадцятого квітня, інспектором корпусу штурманів флоту.
В 1855-1857 роках барон Франгель Фердинанд був морським міністром, обіймав посаду керуючого в міністерстві. На даний момент воно має назву Міністерство морських справ. У цьому ж році він отримав орден святого Володимира другого ступеня.
