Методологія
ДНК одного організму мітили, потім змішували з не меченной ДНК, яку можна було порівняти з нею. Суміш інкубують, щоб дозволити ланцюгах ДНК дисоціювати і потім охолоджуватися з утворенням оновленої гібридної дволанцюжкової ДНК. Гибридизированные послідовності з високим ступенем подібності будуть більш жорстко зв’язуватися і вимагають більше енергії для їх поділу: тобто вони розділяються при нагріванні при більш високій температурі, ніж різнорідні послідовності, процес, відомий як «плавлення ДНК».
Плавлення ДНК
Оцінюючи профіль плавлення гибридизованной ДНК, двухцепочечную ДНК пов’язують з так званою “колонкою”, а отриману суміш нагрівають. На кожному етапі колонку промивають, а послідовності ДНК, які плавляться, стають одноцепочечными і змивають колону. Температури, при яких помічена ДНК виходить з колонки, відображає кількість подібності між послідовностями (і зразок самосгибания служить в якості контролю). Ці результати об’єднані, щоб визначити ступінь генетичної подібності між організмами. Як стверджує сучасна мікробіологія, гібридизація ДНК неможливо без розуміння цих речей.
Коли кілька видів рибонуклеїнової (або дизоксирибонуклеиновой) кислоти порівнюються таким чином, значення подібності дозволяють розміщувати види в філогенетичному дереві. Отже, це один з можливих підходів до проведення молекулярної систематики. Чарльз Сіблі і Джон Альквист, піонери цієї техніки, використовували ДНК-ДНК-гібридизацію для вивчення філогенетичних відносин птахів (систематика Сіблі-Алквиста) і приматів.
