Недоліки
Теорія Бора не до кінця поривала з класичною фізикою. Вона як і раніше зберігала ідею орбітального руху електронів в електромагнітному полі ядра. Ідея про квантуванні при переході з одного стаціонарного стану в інший вдало доповнювала планетарну модель, але все ж не вирішувала всіх протиріч.
Хоча у світлі моделі Бора електрон не міг перейти в рух по спіралі і впасти на ядро, безперервно випромінюючи енергію, залишалося незрозумілим, чому він не міг послідовно підніматися на більш високі енергетичні рівні. В цьому випадку всі електрони рано чи пізно опинилися б у найнижчому енергетичному стані, що призвело б руйнування атома. Іншою проблемою стали аномалії в атомних спектрах, які теорія не пояснювала. Ще в 1896 році Пітер Зееман провів цікавий експеримент. Він помістив атомний газ в магнітне поле і зняв спектрограмму. Виявилося, що деякі спектральні лінії розщепилися на кілька. Такий ефект в теорії Бора пояснення не отримував.