Високопродуктивні технології протеомические
Протеоміка – наука, яка неухильно набирала обертів протягом останнього десятиліття. Багато з підходів, розроблених цією наукою, абсолютно революційні, деякі ж ґрунтуються на старих наукових методах. Методи на основі мас-спектрометрії та микроячейки є найбільш поширеними технологіями для великомасштабного вивчення білків.
Мас-спектрометрія і профілювання
В даний час для профілювання білка використовуються два методу мас-спектрометрії. Більш відомий і широко поширений метод використовує двомірний електрофорез з високою роздільною здатністю для поділу білків з різних зразків паралельно з подальшим відбором і фарбуванням диференційованих експресованих білків, які повинні бути ідентифіковані за допомогою мас-спектрометрії. Незважаючи на досягнення в 2DE і загальної опрацьованості цього методу, він також має свої межі. Основною проблемою є нездатність ідентифікувати всі білки в зразку, враховуючи їх варіативність та інші унікальні властивості.
Другий кількісний підхід використовує стабільні мітки ізотопу для диференційованих міток білків з двох різних складних сумішей. Тут білки в складній суміші спершу позначаються ізотопами, а потім розщеплюються з отриманням мічених пептидів. Потім мічені суміші об’єднують, причому пептиди поділяють багатовимірної рідинної хроматографією і аналізують за допомогою тандемною мас-спектрометрії. Изотопно-кодовані мітки (ICAT) являють собою широко використовуються ізотопні мітки. У цьому науковому методі цистеїнові залишки білків ковалентно приєднуються до реагенту ICAT, тим самим знижуючи складність сумішей, що виключають залишки, відмінні від цистеїну.
Протеоміка, геноміка, метаболомика – нові напрямки в біології, що відрізняються складністю та інноваційністю. Далеко не кожному під силу їх вивчення.
