Додаткові зміни
Крім фосфорилювання і убиквитинирования, білки можуть бути піддані (зокрема) метилированию, ацетилювання, гликозилированию, окислення і нитрозилированию. Деякі білки піддаються всім цим змінам, часто залежать від часу комбінаціях. Це ілюструє потенційну складність вивчення структури і функції білка.
Окремі білки, що виробляються в різних умовах. Клітина може створювати різні набори білків у різний час або в різних умовах, наприклад, під час розвитку, клітинної диференціації, клітинного циклу або канцерогенезу. Подальше збільшення складності протеому, як вже згадувалося, передбачає, що більшість білків можуть піддаватися широкого спектру посттрансляційних модифікацій.
Тому дослідження в області протеоміки – це в перспективі складне завдання, навіть якщо тема вивчення цієї науки, як і раніше, буде обмеженою. При більш амбітні завдання, наприклад, коли шукають біомаркери для конкретного підтипу раку, вчений-протеомист може вибрати вивчення декількох зразків сироватки крові у декількох пацієнтів з раком, щоб звести до мінімуму змішуючі фактори. Таким чином, складні експериментальні конструкції іноді необхідні для обліку динамічної складності протеому.
