Відмінності від геноміки
Протеоміка дає різні рівні розуміння, ніж геноміка з багатьох причин:
- Рівень транскрипції гена дає лише приблизну оцінку його рівня трансляції в білок. Отриману в достатку мРНК можна швидко деградувати або трансформувати не найефективнішим чином, у результаті чого утворюється невелика кількість білка.
- Як згадано вище, багато білки зазнають посттрансляционные модифікації, які сильно впливають на їх функціональність. Наприклад, деякі білки не активні до тих пір, поки не стануть фосфорилированными. Методи, такі як фосфопротеомика і гликопротеомика, використовуються для вивчення посттрансляційних модифікацій.
- Багато транскрипти призводять до появи більш одного білка, шляхом альтернативного зрощування або альтернативних посттрансляційних модифікацій.
- Багато білки утворюють комплекси з іншими білками або молекулами РНК і діють тільки у присутності інших молекул. Ступінь деградації білка відіграє важливу роль в його змісті.