Принципи номенклатури ферментів
В даний час існує три підходи до формування назв ферментів. Відповідно до них виділяють такі типи номенклатури:
- тривіальна (найстаріша система);
- робоча — зручна у використанні, дуже часто використовується в навчальній літературі;
- систематична (або наукова) — найбільш докладно і точно характеризує механізм дії ферменту, але надто складна для повсякденного вживання.
Систематична і робоча номенклатури ферментів мають спільну рису, яка полягає в приєднанні до кінця будь-якого назви суфікса “аза”. Останній є свого роду “візитною карткою” ензимів, що виділяє їх з ряду інших груп біологічних сполук.
Існує ще одна система складання найменувань, заснована на будові ферменту. Номенклатура в такому випадку робить акцент не на тип хімічної реакції, а на просторову структуру молекули.
Крім власне назви частиною номенклатури ензимів є їх індексація, згідно з якою кожному энзиму відповідає свій класифікаційний номер. У базах даних ферментів зазвичай вказуються їх шифр, робочий і наукове назви, а також схема хімічної реакції.
Сучасні принципи побудови номенклатури ферментів засновані на трьох характеристиках:
- особливості здійснюється ензимом хімічної реакції;
- клас ферменту;
- субстрат, до якого застосовується каталітична активність.
Особливості розкриття цих пунктів залежать від типу номенклатури (робоча або систематичне) та підкласи ферменту, до якого вони застосовуються.