Гідролази
Гідролази поділяються на підкласи за характером субстрату. Найбільш важливими з них є:
- естерази, відповідальні за розщеплення складних ефірів;
- глікозідази – гідролізують глікозиди (включаючи вуглеводи);
- пептид-гідролази – руйнують пептидні зв’язки;
- ферменти, що розщеплюють непептидные C-N-зв’язку
У групппу гідролаз входить близько 500 ферментів.
Ліази
Негидролитическому відщеплювання під дією ліаз можуть піддаватися багато груп, включаючи CO2, NH2, H2O, SH2 та ін При цьому відбувається розпад молекул зв’язків С-О, С-З, C-N і т. д. Одним з найважливіших підкласів даної групи є улерод-вуглець-ліази.
Деякі реакції відщеплення є оборотними. В таких випадках при певних умовах ліази можуть каталізувати не тільки розпад, але і синтез.
Лігази
Всі лігази поділяються на дві групи в залежності від того, яке з’єднання дає енергію для утворення ковалентного зв’язку. Ферменти, що використовують нуклеозидтрифосфаты (АТФ, ГТФ і т. д.), називають синтетазами. Лігази, дія яких пов’язане з іншими макроэргическими сполуками, іменують синтазами.